Situé dans la zone des Clairions, il compte près de 600 élèves.
Il accueille des ULIS TFC (Unités locales d'inclusion scolaire de Troubles des Fonctions Cognitives).
Les communes rattachées au collège : Héry, Monéteau, Montigny-la-Resle, Rouvray, Seignelay, Venouse, Villeneuve-Saint-Salves.
Les écoles d'Auxerre rattachées au collège : École élémentaire Brazza, Les Clairions, Jonches, Laborde.
Le site internet : http://col89-albertcamus.ac-dijon.fr/
Situé aux Piedalloues, il compte près de 700 élèves.
Cet établissement scolaire met à disposition des élèves une section sportive football pour les 4ème et les 3ème.
Il accueille des SEGPAS et des ULIS TFC.
Les communes rattachées au collège : Augy, Bleigny-le-Carreau, Champs-sur-Yonne, Quenne, Escolives-Sainte-Camille, Coulanges-la-Vineuse, Saint-Bris-le-Vineux, Jussy.
Les écoles d'Auxerre rattachées au collège : École élémentaire Rive Droite, Les Piedalloues, Vaux.
Le site internet : http://collegepaulbertauxerre.fr/spip3/
Il accueille des SEGPAS et des ULIS TFC.
Les communes rattachées au collège : Venoy.
Les écoles d'Auxerre rattachées au collège : École élémentaire Martineau de Chesnez, de Paris, du Pont, les Rosoirs, Les Boussicats.
Le site internet : http://col89-denfert-rochereau.ac-dijon.fr/
Situé vers en haut de la zone des Clairions, il compte à peu près 730 élèves.
Il met à disposition une classe spécialisée dans le numérique.
Il accueille également des ULIS TFC.
Le site internet : http://www.saint-joseph-auxerre.fr/index.php