Le Silex programme à la fois des groupes confirmés comme des découvertes nationales tout en laissant une large place aux groupes locaux. L’ensemble du champ des musiques actuelles (rock, électro, reggae, blues, chanson, etc) est présenté sur des périodes données lors de près de 100 concerts par saison partagés entre la programmation du Silex (musiques actuelles), le Jazz Club d'Auxerre et le Catalpa Festival.